domingo, 11 de diciembre de 2016

De fósiles vivientes y genomas

Este árbol es famoso por ser un "fósil viviente", un término usado para describir aquellos organismo que apenas han cambiado a lo largo de miles de años. En el caso del ginkho, hay especímenes conservados en registro fósil de hace 270 millones de años, en el Período Pérmico.

Los investigadores creen que la nueva información podría ayudar a explicar el éxito evolutivo del árbol. Su resiliencia es legendaria: fue una de las pocas especies vivientes que sobrevivieron a la bomba atómica de Hiroshima en 1945. El ginkgo es conocido por producir sustancias químicas desagradables para los insectos que intentan comerlo, y que también son efectivas contra hongos y bacterias. Los investigadores pueden ahora identificar los mecanismos responsables de esas capacidades.

En concreto, la especie secuenciada en este estudio ha sido Ginkgo biloba, la especie no extinta del género Ginkgo. Su genoma es enorme, con más de 10.6 billones de "letras" formando su ADN. El genoma humano contiene solo 3 billones.

Escritos en el código de ADN del Ginkgo hay aproximadamente unos 41.840 genes potenciales, las "plantillas" que las células del árbol utilizan para hacer las proteínas que construyen y mantienen el organismo. El análisis inicial del genoma, publicado en la revista GigaScience, sugiere que ha habido una amplia expansión a través del tiempo de las familias de genes que proporcionan una variedad de mecanismos defensivos.

Su arsenal antiinsectos es particularmente inteligente. El Ginkgo sintetizará un conjunto de productos químicos para combatir directamente una plaga, pero también lanzará otro conjunto de compuestos que atraen específicamente a los enemigos del insecto.


The tree is famed for being a “living fossil” - a term used to describe those organisms that have experienced very little change over millions of years.In the case of the Ginkgo, there are specimens preserved in the rock record from 270 million years ago, in the Permian Period.

The Chinese-led research team says the new information should help to explain the tree’s evolutionary success.

Its resilience is legendary: it was one of the few living things to survive the atomic bomb blast in the Japanese city of Hiroshima in 1945.A Ginkgo is known to produce chemicals that are unpalatable to the insects that try to eat it, and will counter the fungi and bacteria that attempt to attack it. Researchers can now more easily identify the mechanisms that drive these capabilities.

The specific species sequenced in the study was Ginkgo biloba. It reveals the tree’s genome to be huge, comprising some 10.6 billion DNA "letters".By way of comparison, the human genome contains just three billion letters.

Written in the Ginkgo’s DNA code are roughly 41,840 predicted genes, the “templates” that the tree’s cells use to make the complex protein molecules that build and maintain the organism. The initial analysis of the genome, published in the journal GigaScience, suggests there has been extensive expansion through time of gene families that provide for a variety of defensive mechanisms. 

Its anti-insect arsenal is particularly smart. The Ginkgo will synthesise one set of chemicals to directly fight a pest, but also release another set of compounds that specifically attract the insect’s enemies.

Fuente: BBC

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